複数の源泉徴収票がある場合の確定申告書作成について

個人事業主として事業所得、パートとして給与所得がある者です。
2025年の確定申告についてご質問です。

給与所得については、下記3社から源泉徴収票を受け取っています。
A社：2025年中に退社済みで源泉徴収票を受領済み
B社：A社の源泉徴収票を提出し年末調整済み、源泉徴収票受領済み
C社：年末調整できておらず、源泉徴収票受領済み

Freeeで確定申告書を作成するにあたり、下記3点ご質問です。

①会社から給与を受け取っている人が源泉徴収票の内容を転記する欄があるのですが、この場合A社の内容はB社の源泉徴収票に含まれていると考えて、B社とC社の源泉徴収票のみ内容転記すればよいでしょうか。

②年末調整後に世帯主を変更した関係で2025年の国保料が変更となり、B社の内容をそのまま転記すると、できあがった確定申告書に変更前の国保料が載る形になります。
そのため転記時に国保料のみ正しい金額に修正し、できあがった確定申告書に変更後の国保料が記載されていれば大丈夫でしょうか。

③国保料に変更があった場合、B社の源泉徴収票の他の数字に影響が出る(数字が変更になる)ことはないでしょうか。国保料以外の数字はそのままの転記で問題ないかが心配です。
入力した項目は支払金額、所得控除の額の合計金額、源泉徴収税額(0円)、新生命保険料の金額、介護医療保険料の金額です。

ご回答よろしくお願いいたします。

個人事業主の確定申告

投稿日：2026/02/12
回答件数：1件

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平賀大二郎税理士事務所
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①について
ご認識のとおりですが、念のためにB社の源泉徴収票の下の部分にA社での支払金額などが記載されているか確認ください。そのうえで概算でよいので支払金額はA社とB社の両方の合計が支払金額に記載されているかも確認ください。
②について
健康保険料は2025年中に実際に支払った金額が社会保険料控除となります。変更後の金額で2025年中に支払っていればその支払った金額に修正して確定申告書に記載します。
通知があっただけで変更後で支払ってなければ従前の支払い金額を記載することになります。
③について
国保料以外の金額は、間違い等なければ基本的にそのまま転記することとなります。

ご参考になれば幸いです。
回答日：2026-02-13
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