Amazon販売に関する仕訳について

Amazon販売に関する仕訳についてご存知の方がいましたらご回答お願い致します。
Amazonの毎月の売上レポート(トランザクション)売上と手数料が取引ごとに記載されたレポートと月次の概要レポート(売上と手数料の内訳)の2つを使って純額で仕訳を行っております。売上、Amazon手数料部分は金額が一致しますが、その他の手数料の部分でトランザクションに記載のない(概要レポートには記載あり)部分の手数料が一致しません。
この場合、Amazonから入金時の振替処理の時に合わない部分の手数料を計上してもよろしいのでしょうか？詳しい方がいましたら回答お願い致します。