副業20万以下でも住民税を普通徴収にしたいので確定申告してもいいか

10月から正社員として働き始め、以前アルバイトで働いていたところは9月から業務委託に変更して副業として続けています。（住所のある大津市は給与所得者は原則特別徴収と書いていたので、業務委託に変えてもらいました）
会社にバレないように、副業分の住民税は普通徴収にしたいのですが、確定申告で「自分で納付」欄にチェックすればいいだけでしょうか？
20万以下は確定申告不要とのことですが、自分で納付にしたいために確定申告をしてもいいのでしょうか？
20万以下は住民税の申告書のみ書けばいいと思いますが、申告に必要な支払い証明書がないため、確定申告をするしかないのかなと考えています。

また、業務委託で働いているところでは、源泉徴収なしでデザインの業務をしていますが、ネットで調べると業務委託でもデザインの仕事は源泉徴収が必要だと出てきたりします。
会社の人もあまりわかってないと思いますが、もし源泉徴収が必要な場合、正社員として働いている会社に8月までの源泉徴収を年末調整のためにもう提出していますが、業務委託変更後の分だけ確定申告をするとなると、ややこしいことになるのでしょうか。