本支店会計

本支店会計を行っていて、日々の業務は本支店それぞれで行い決算時に連結となります。決算時に本店へ支店の数字が振替伝票で入力されております。この場合は期首の最初に、支店の数字を抜く仕訳を入力しなければならないのでしょうか？半年が経過し本支店を合わせてみようとした所、本店に支店の数字が入っているので困っております。